Le fait que le projet soit mal défini dans le dossier d'étude d'impact préliminaire à la déclaration d'utilité publique est un grand frein à la compréhension de son fonctionnement dans l'environnement. Les études initiales des lieux tant environnementales, sociales, économiques, courantologiques que de la bathymétrie sont malheureusement incomplètes. Enfin, la modélisation du projet n'a pas été réalisée, ni les études en bassin, il n'y a pas non plus d'étude sociologique, il manque des mesures compensatoires, etc.

     Cependant, malgré ces nombreux points d'ombre, à partir de cette étude d'impact on peut avancer certaines conclusions sur les conséquences qu'engendrerait ce projet s'il venait à être réalisé :

Environnement :
     - Destruction partielle du caractère remarquable de la côte Brétignollaise.
     - Zones classées protection de la nature détruites et espèces protégées anéanties.
     - Zone humide du Marais Girard inefficace, risques d'inondations dans le bourg.
     - Vidange de la nappe phréatique sous Brétignolles, dessèchement des sources et plantations.
     - Démantèlement d'une exploitation d'agriculture biologique
     - Pollutions des eaux de baignade, crustacés et rejets de sable de dragage potentiellement pollué.

Sociologie :
     - Perte identitaire ; entre tourisme familial et le tourisme de "qualité".
     - Impact négatif sur l'emploi touristique durant les 3 ans de travaux.
     - Réduction de la fréquentation touristique familiale, diminution des revenus touristiques traditionnels.

Navigabilité :
     - Dangers extrêmes à partir de 4 Beaufort.
     - Plus dangereux que port Bourgenay (Naufrage de la vedette SNSM et décès en entrée de port)

Archéologie-Géologie :
     - Dangers d'érosion pour la côte rocheuse remarquable, de plus de 100 millions d'année.
     - Zone archéologique de grand intérêt, les tourbes antiques du Marais Girard seraient fouillées en détail avant les travaux (quelques années de retard pour les travaux).

Erosion :
     - Comblement régulier du chenal par le transit du sable.
     - Recul des plages de la Normandelière et des Dunes.
     - Eventuelle constructions d'épis rocheux pour limiter le recul des plages (comme à l'Epine, Noirmoutier).

Economie :
     - Seulement quelques emplois créés pour une dépense de plus de 60 M€.
     - Surendettement de la commune de Brétignolles sur mer.
     - Modification profonde de l'offre commerçante.
     - Aucune justification économique du projet.

Urbanisme, loi littoral :
     - Lois établies pour la protection de la nature bafouées. Nouvelle jurisprudence ?